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北海市地方税务局下辖合浦县地方税务局，内设8个职能科室（办公室、人事教育科、征收管理科（计算机信息管理中心）、法规宣传科、税政科、所得税科、计划财务科、监察室），1个直属事业单位（机关后勤服务中心），2个直属机构（直属税务分局、稽查局），4个城区局（北海市工业园区地方税务局、北海市海城区地方税务局、北海市银海区地方税务局、北海市铁山港区地方税务局），8个派出机构（北海市海城区地方税务局涠洲税务所、北海市银海区地方税务局平阳税务所、北海市银海区地方税务局福成税务所、北海市银海区地方税务局银滩税务所、北海市银海区地方税务局侨港税务所、北海市铁山港区地方税务局南康税务所、北海市铁山港区地方税务局营盘税务所、北海市铁山港区地方税务局兴港税务所）。 | 
